| Дата | Место проведения | Анализ | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 1/8 финала | |||||
| 10.05.2009 | «Восток» Целинное | 0:5 | «Спартак» Горно-Алтайск | — | |
| 17.05.2009 | «Динамо» Бийск | 2:0 | «Ника» Бийск | — | |
| 10.05.2009 | «Урожай» Кытманово | 3:0 | «Горизонт-1991» Барнаул | — | |
| 10.05.2009 | «Смена» Ребриха | 3:0 | «Спартак» Камень-на-Оби | — | |
| 10.05.2009 | «Урожай» Михайловское | +:- | «Горняк» Горняк | — | |
| 10.05.2009 | «Урожай» Родино | 1:2 | «Химик-Арсал» Яровое | — | |
| 09.05.2009 | «Юность-Элеватор» Ключи | 7:1 | «Локомотив» Кулунда | — | |
| 16.05.2009 | «Барнаул» Барнаул | 8:0 | «Арагац» Барнаул | — | |
| 1/4 финала | |||||
| 04.06.2009 | «Спартак» Горно-Алтайск | 1:3 | «Динамо» Бийск | — | |
| 17.05.2009 | «Смена» Ребриха | 4:0 | «Урожай» Кытманово | — | |
| 23.05.2009 | «Урожай» Михайловское | 1:2 | «Химик-Арсал» Яровое | — | |
| 07.06.2009 | «Барнаул» Барнаул | 7:0 | «Юность-Элеватор» Ключи | — | |
| 1/2 финала | |||||
| 18.06.2009 | «Смена» Ребриха | 0:5 | «Динамо» Бийск | — | |
| 20.06.2009 | «Химик-Арсал» Яровое | 1:3 | «Барнаул» Барнаул | — | |
| Финал | |||||
| 08.08.2009 | «Динамо» Бийск | 2:1 | «Барнаул» Барнаул | — | |
